基于网络药理学研究黄连解毒汤抗幽门螺杆菌感染作用机制

目的运用网络药理学方法预测黄连解毒汤抗Hp感染的主要有效成分、靶点及信号通路,挖掘其潜在作用机制,为后续实验研究提供依据。方法应用TCMSP筛选黄连解毒汤中黄连、黄芩、黄柏、栀子4味中药的主要有效成分及其潜在作用靶点。通过GeneCards数据库和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选Hp感染相关靶点,并取药物和疾病的交集靶点。将交集靶点导入Cytoscape 3.7.2构建有效成分和Hp感染相关靶点网络,并进行拓扑学分析。应用STRING在线分析平台构建靶蛋白相互作用(PPI)网络并进行分析。运用R语言在线检索Bioconductor平台对靶点进行GO功能富集;通过DAVID数据库对靶点进行KEGG通路富集分析。结果黄连解毒汤中共筛选出85个有效成分,主要包括槲皮素、小檗碱、山柰酚、汉黄芩素、黄芩素等。对应靶点112个,疾病相关靶点1960个,药物疾病共同靶点71个。网络中度值最高的有效成分为槲皮素,度值最高的靶点为环加氧酶1(PTGS1)。PPI网络中69个节点中度值较高的靶蛋白包括半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、IL6、MAPK8、原癌基因(MYC)、VEGFA、表皮生长因子受体(EGFR)等。GO功能富集分析共获得89个条目,KEGG通路富集分析共筛选12条存在显著差异的信号通路,其中发挥主要作用的有癌症通路、ErbB信号通路、p53信号通路、凋亡、黏附斑等。结论黄连解毒汤可通过多成分、多靶点、多通路发挥对Hp的治疗作用,可通过抗肿瘤机制调控胃癌进程,本研究可为其有效成分研究和抗Hp机制研究提供依据。     

Genetic variation of 17 autosomal STR loci in the Lahu population from Yunnan and phylogenetic structure exploration among 28 populations

This study evaluated the genetic variation of 17 autosomal short tandem repeat (STR) loci included in the PowerPlex® 18D Kit. Samples of 562 unrelated healthy Lahu individuals living in Yunnan Province in southwestern China were investigated. The data were analyzed to provide information on allele frequencies and other statistical parameters relevant to the forensic population. Of the 17 loci, 16 reached the Hardy–Weinberg equilibrium after Bonferroni correction. A total of 176 alleles were identified in 17 STR loci, and allele frequencies ranged from 0.000 890 to 0.578 292. The combined discrimination power (CPD) and probability of excluding paternity (CPE) of the 17 STR loci were 0.999 999 999 999 999 999 489 and 0.999 998 301 753 122. The genetic relationships among 28 populations were also estimated.     

基于网络药理学探讨清金化浊方治疗慢阻肺的作用机制＊

目的 利用网络药理学方法探讨清金化浊方治疗慢阻肺的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库和分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology，TCMSP）平台检索组方君臣药物的主要化学成分及作用靶点，通过TTD、CTD、DisGeNET、GeneCards数据库获得慢性阻塞性肺疾病（Chronic Obstructive Pulmonary Disease，COPD）相关靶点，筛选药物与疾病的交集靶点及有效活性成分。利用Cytoscape3.7.2构建药物-化合物-靶点-疾病网络，利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用关系（Protein-Protein Interaction，PPI）网络 拓扑分析图，并分析核心靶点。利用DAVID数据库进行基因功能（Gene Ontology，GO）和基于京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）富集分析，并绘制通路-靶点网络图。基于网络分析结果，纳入2020年1月-2021年1月我科收治的AECOPD患者，采用区组随机法按1：1分为对照组（西医治疗组）、研究组（清金化浊方联合西医治疗组），比较两组患者的IL-6、TNF-α水平。结果 筛选得到164个中药成分靶点，3051个COPD靶点，映射得出药物-疾病交集靶点112个。分析得出清金化浊方治疗COPD主要有槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇、木犀草素等有效活性成分，涉及IL-6、TNF、MAPK3、VEGFA、TP53、PTGS2、MAPK1、PIK3CG等关键靶点。富集于药物反应、一氧化氮生物合成过程的正调控、缺氧反应等生物过程及83条信号通路，其中TNF、HIF-1和PI3K-Akt信号通路在COPD的治疗中最为重要。临床研究显示，两组治疗7天后IL-6、TNF-α均较治疗前下降；治疗后组间比较，研究组低于对照组（P<0.05）。结论 清金化浊方主要以抗炎为核心，兼有调节氧平衡、降低气道黏液高分泌、改善气道重塑、调节免疫功能及血液高凝状态等多方面的作用，为其临床应用提供一定指导价值，亦为进一步开展后续课题研究提供科学依据。     

基于代谢组学探讨艾灸关元穴对老年大鼠肾能量代谢的影响＊

目的 通过UHPLC-Q-TOF-MS代谢组学探讨艾灸关元穴对老年大鼠肾代谢物的影响，进而为艾灸关元穴的作用机制提供参考。方法 将8月龄SD雄性大鼠设为成年对照组（8只），21月龄SD雄性大鼠随机分为老年对照组（8只）、老年金匮肾气丸组（7只）、老年艾灸组（8只）。老年金匮肾气丸组每日按体重给药，老年艾灸组每日艾灸关元穴15 min，均每周5天。实验持续13周后检测大鼠肾组织线粒体呼吸耗氧速率、琥珀酸脱氢酶（SDH）活性以及血清肾功能指标，观察肾脏病理变化，结合UHPLC-Q-TOF-MS技术对大鼠的肾组织进行代谢轮廓分析，筛选代谢差异物并进行鉴定。结果 与老年对照组比较，老年艾灸组大鼠肾线粒体的呼吸耗氧速率和SDH酶的活力显著提高（P<0.01）。代谢组学结果显示，肾组织中筛选出13个共同差异化合物，分别是丁酸十二烷基酯、亚油酰胺、5-甲基四氢叶酸、PC（16∶0/22∶5（7Z，10Z，13Z，16Z，19Z））、6，8-二羟基嘌呤、1，2，3-丙烷三羧酸、3-（4-甲氧基苯基）-2-氧代丙酸、吲哚-3-乙酰甘氨酸、亚麻油酸、9，10-环氧十八烷酸、二十二碳五烯酸（22n-6）、牛磺胆酸、LysoPS （18∶0/0∶0）。结论 艾灸关元穴可通过调控老年大鼠的牛磺酸和亚牛磺酸代谢、α-亚麻酸代谢、亚油酸代谢、甘油磷脂代谢来调节肾的能量代谢。     

Germline gain-of-function MMP11 variant results in an aggressive form of colorectal cancer

Matrix metalloproteinase-11 (MMP11) is an enzyme with proteolytic activity against matrix and nonmatrix proteins. Although most MMPs are secreted as inactive proenzymes and are later activated extracellularly, MMP11 is activated intracellularly by furin within the constitutive secretory pathway. It is a key factor in physiological tissue remodeling and its alteration may play an important role in the progression of epithelial malignancies and other diseases. TCGA colon and colorectal adenocarcinoma data showed that upregulation of MMP11 expression correlates with tumorigenesis and malignancy. Here, we provide evidence that a germline variant in the MMP11 gene (NM_005940: c.232C>T; p.(Pro78Ser)), identified by whole exome sequencing, can increase the tumorigenic properties of colorectal cancer (CRC) cells. P78S is located in the prodomain region, which is responsible for blocking MMP11's protease activity. This variant was detected in the proband and all the cancer-affected family members analyzed, while it was not detected in healthy relatives. In silico analyses predict that P78S could have an impact on the activation of the enzyme. Furthermore, our in vitro analyses show that the expression of P78S in HCT116 cells increases tumor cell invasion and proliferation. In summary, our results show that this variant could modify the structure of the MMP11 prodomain, producing a premature or uncontrolled activation of the enzyme that may contribute to an early CRC onset in these patients. The study of this gene in other CRC cases will provide further information about its role in CRC development, which might improve patient treatment in the future.     

不同时期COPD患者血清DcR3、Survivin表达水平及临床意义

目的 探讨不同时期慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者血清诱饵受体3(DcR3)、凋亡抑制蛋白(Survivin)表达水平及临床意义。方法 选取2018年9月—2019年12月本院收治的92名COPD患者为研究对象,其中稳定型COPD 50例,急性加重期COPD 42例;同期本院健康体检者88例为对照组。测定各组研究对象血清DcR3、Survivin水平及肺功能指标。 与对照组[DcR3(106.54±48.35)pg/mL,Survivin(98.85±26.59)pg/mL]比较,稳定期组和急性加重期组血清DcR3[(395.23±123.85)pg/mL,(1 248.81±213.59)pg/mL]、Survivin [(267.54±84.69)pg/mL,(1 233.95±307.26)pg/mL]水平升高;与稳定期组比较,急性加重期组血清DcR3、Survivin水平升高。与对照组比较,稳定期组和急性加重期组FEV1%、FEV1 /FVC、DLCO%水平降低(P<0.001);与稳定期组比较,急性加重期组FEV1%、FEV1 /FVC、DLCO%水平降低(P<0.001)。随着低氧血症严重程度的增加,COPD患者血清DcR3、Survivin水平逐渐增加(P<0.001)。多因素logistics回归分析显示,高水平DcR3、Survivin、IL-12、hs-CRP为COPD病情的危险因素(P<0.001)。DcR3、Survivin与FEV、FEV1 /FVC呈负相关,与IL-12、TNF-α、hs-CRP呈正相关(P<0.001)。 COPD稳定期、急性加重期患者血清DcR3、Survivin表达水平升高,且DcR3、Survivin与COPD病情严重程度呈正相关。     

利用转录组测序生物信息学初步探讨热射病预后关键基因

目的分析热射病患者外周血单个核细胞转录组测序生物信息学结果,寻找影响热射病预后的关键基因。方法选取2019-06-01~2020-08-30空军军医大学附属西京医院急诊科收治的热射病患者,按照预后分为生存组和死亡组。随机数字法在两组中分别选取患者进行外周血单个核细胞转录组测序,生物信息学分析寻找差异基因;RT-PCR验证筛选出的差异基因在生存组和死亡组中的表达。结果29例诊断为热射病患者入选,按照预后分为生存组和死亡组,其中生存组18例,死亡组11例。随机数字法选取6例生存患者和4例死亡患者,外周血单个核细胞进行转录组测序,两组患者有693个基因表达有明显差异,通过生物信息学分析筛选出趋化因子(C-C基元)配体5(CCL5)、基质金属蛋白酶8(MMP8)、MMP9基因可能与预后相关。将两组外周血单个核细胞的目标基因表达情况通过RT-PCR法表达检测,与生存组比较,死亡组MMP8基因(P=0.8955)和MMP9基因(P=0.0597)表达无明显变化,CCL5基因表达明显上升(t=7.056,P<0.05)。结论CCL5基因可能是影响热射病预后的关键基因,需要进一步深入研究。     

解偶联蛋白1基因多态性与2型糖尿病心脑血管并发症的相关性

目的探讨解偶联蛋白1(UCP1)基因多态性与2型糖尿病(T2DM)心脑血管并发症的相关性。方法选取2019年7月—2020年7月住院治疗的T2DM 440例,根据有无心脑血管并发症分为观察组(T2DM合并心脑血管并发症)221例和对照组(单纯T2DM)219例。比较两组一般资料,UCP1在rs45539933、rs10011540及rs1800592位点的基因型分布与等位基因频率;通过多因素Logistic回归分析评估T2DM发生心脑血管事件的危险因素。结果观察组病程长于对照组,糖化血红蛋白水平高于对照组,而血清高密度脂蛋白胆固醇水平低于对照组(P<0.01)。观察组C/C基因型分布及C碱基频率均高于对照组(P<0.05)。C/C基因型是T2DM患者发生心脑血管并发症的危险因素(P<0.05)。结论UCP1基因多态性与T2DM心脑血管并发症的发生显著相关。